Для начала нужно убедиться что привод масляного насоса (он же и привод обеих топливных насосов) установлен правильно... есть простой и грубый метод ...
Для этого установи первый цилиндр в ВМТ ( отметка ОТ на маховике) в этом положении в окне под ТННД риски регулировки начала подачи должны быть хорошо видны и находятся аккурат по середине круглого окна. Если муфта ТНВД значительно смещена вверх или вниз -- придётся перекидывать зубья шестерен. Но надеюсь до этого не дойдёт.
Также не мешало бы почитать вот этот материальчик.
http://multikar25.ru/post_1260777668.html
а также...
http://forum.multikar25.ru/showthread.php?t=267